Een virus komt de cel binnen en vele kopieën verlaten de cel.
Als het virus tenminste niet onschadelijk wordt gemaakt door enzymen van de cel.
Want dat is ook mogelijk.
Hoe een virus zich vermenigvuldigt
Het virus laat zijn RNA streng in het grondplasma van de menselijke cel.
Het (positieve) RNA is in feite een Messenger RNA.
Ribosomen van de menselijke cel gaan dan ook 'braaf' het virus RNA vertalen in eiwit.
Hieronder zijn twee figuren te zien van het virus RNA.
Het is 29,674 nucleotiden groot.
Samenstelling en informatie van het virale RNA
Het virale RNA bestaat uit stukken af te lezen RNA, die open reading frames ofwel ORF worden genoemd.
Het eerste stuk ORF 1a en ORF 1b levert een polyproteïne op.
Het andere stuk RNA wordt later gesplitst in kleinere stukken RNA die als mRNA hun eigen eiwitten opleveren. Zij heten ORF 3a tm ORF 10.
Door deze stukken RNA worden structurele eiwitten van het virus getransleerd, onder anderen de 'Spike' van het virus.
ORF 1a en ORF 1b bevatten informatie voor enzymen.
ORF 1 a levert het polyproteïne pp1a
ORF 1 a levert samen met ORF 1b het polyproteïne pp1 ab
ORF 1 levert dus twee verschillende polyproteïne op. Dit is mogelijk doordat sommige ribosomen wel stoppen met translatie bij de start van ORF 1b en andere niet. Dit heet 'frameshifting'.
Bijzonder, onder de enzymen die ontstaan uit de translatie van ORF 1a, bevinden zich twee enzymen, die zich zelfstandig losmaken uit het polyproteïne. Deze enzymen heten proteasen. Deze twee zijn papain-line protease en 3CL-protease.
Deze proteasen knippen de rest van het polyproteïne in 14 stukken nsp. De NSP's ofwel de non structural proteïnes ofwel proteïnen die als enzymen gaan werken.
Figure 1. The genomic organization of SARS-CoV-2. The genome encodes two large genes ORF1a (yellow), ORF1b (blue), which encode 16 non-structural proteins (NSP1– NSP16). These NSPs are processed to form a replication–transcription complex (RTC) that is involved in genome transcription and replication. For example, NSP3 and NSP5 encode for Papain-like protease (PLP) and 3CL-protease, respectively. Both proteins function in polypeptides cleaving and block the host innate immune response. NSP12 encodes for RNA-dependent RNA polymerase (RdRp). NSP15 encodes for RNA helicase. The structural genes encode the structural proteins, spike (S), envelope (E), membrane (M), and nucleocapsid (N), highlighted in green. The accessory proteins (shades of grey) are unique to SARS-CoV-2 in terms of number, genomic organization, sequence, and function (figure created with biorender.com).
De 14 NSP's wat doen ze?
Deze enzymen vormen complexen, die het virus RNA vermenigvuldigen.
Een deel van de vermenigvuldigde RNA moleculen wordt kern van nieuwe virussen.
Een ander deel wordt gesplitst in subgenomic RNA, dat de structurele eiwitten oplevert.
Deze processen worden hieronder geïllustreerd.
Science direct